De Raad van State heeft in augustus 2012 een koepelvergunning voor een aantal grote projecten in de Veluwerandmeren vernietigd. Dit had niet alleen consequenties voor projecten die in voorbereiding waren, maar ook voor projecten die al in uitvoering waren. Zoals het verleggen van de vaargeul in het Wolderwijd. De detailvergunning die de Provincie Flevoland hiervoor had verleend was gekoppeld aan de vernietigde koepelvergunning. Eind augustus 2012 trok de Provincie Flevoland deze detailvergunning dan ook in. Het werk dat voorjaar 2012 was begonnen, lag sindsdien stil.
Juli 2013 is door de Zandwincombinatie Wolderwijd opnieuw een Natuurbeschermings-wetvergunning aangevraagd. Toen deze vergunning definitief werd toegekend, kon vanaf 1 april het restant van de vaargeul worden aangelegd.
Door het verleggen van de vaargeul wordt de aansluiting van de hoofdvaargeul (ten zuiden van Knarland) op de brug overzichtelijker en veiliger en komt er een betere scheiding tussen de scheepvaart in de vaargeulen en watersporters daarbuiten. Ook komt er voor de recreatievaart een veiliger route van de vaargeul naar het aquaduct.
Tenslotte onstaat een duidelijke zonering van beroeps- en recreatievaart aan de ene kant en ondiepe, ecologisch waardevolle delen aan de andere kant.